GeneAnalytics——功能强大的基因注释分析工具—科研工具箱

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功能强大且易于使用的工具

GeneAnalytics是由生物学家为生物学家产生的。

我们的生物学专家团队根据大多数生物学家正在寻找的结果类型进行调整,并设计了这个工具,不需要生物信息学背景或专业知识。

基因符号的简单输入激活了快速鉴定和分析过程。GeneAnalytics为用户提供了清晰组织的结果,更多信息的链接,强大的过滤器,基因注释和下载能力。

 多源集成

GeneAnalytics由100多个数据源提供支持,这些数据源经过建模并集成到LifeMap集成生物医学知识库中。

基因表达分析利用了 LifeMap 发现®中针对正常组织和细胞以及 MalaCards 中针对患病组织提供的大量组织和细胞基因表达数据。

基于功能的分析利用了基因卡,马拉卡®和PathCard中集成的信息, 这些信息提供了与疾病,途径,化合物和基因本体(GO)术语的基因关联。

分类结果输出

为了更好地了解您的基因集的上下文,Gene分析中的匹配结果分为以下几类:

  • 组织和细胞:根据基因表达谱将您的基因集与正常组织和细胞相匹配。
  • 疾病:通过遗传关联(例如,致病突变、危险因素)、患病组织中的差异表达和/或从 GeneCards 派生的关联(“GeneCards 推断”),将您的基因集与与疾病相关的基因进行匹配
  • 通路:将您的基因集与 SuperPaths 的基因内容(即来自许多通路源的通路簇)相匹配。超级路径及其组成路径都显示在匹配结果中。
  • 基因本体(GO):将您的基因集与富集GO项相匹配,以尝试定义基因集功能。
  • 化合物:将您的基因集与从多个数据源统一的化合物的聚合基因列表相匹配。

每个匹配的实体都显示其匹配的分数,指向证据来源和有关该实体的更多信息的链接,以及匹配基因的列表。

获取支持信息

强大的GeneAnalytics接口将每个匹配的实体链接到LifeMap集成生物医学知识库中的特定卡,或外部数据源,为组织,细胞,疾病和途径提供广泛而全面的信息。我们知识库套件的可用互连链接可为您节省宝贵的时间。

专有表达式数据

GeneAnalytics中基于表达的分析结果基于手动收集,过滤,建模,注释并集成到LifeMap发现中的数据。

基因表达数据来自科学文献、高通量实验、原位杂交和免疫染色大规模数据集。高通量数据经过统计分析和过滤,以确保仅包含可靠且重要的基因。

收集了正常、未受影响的发育细胞和成体细胞、解剖区室、体内器官和组织以及干细胞、祖细胞和原代细胞及其分化衍生物的体外研究的匹配基因表达数据。这些数据可以在基因分析的“组织/细胞”部分查看。

患病组织和细胞的基因表达数据与正常表达数据分离,并显示在GeneAnalytics的疾病部分。这些数据包括与从未受影响的受试者获得的相同组织相比,发现患病组织中显着上调或下调的基因。

专有和独特的匹配算法

组织&细胞匹配算法考虑了每个特定组织或细胞中每个基因的基因选择性、特异性、富集度和丰度信息。疾病匹配算法考虑基因注释,例如;基因疾病关联和数据来源。

基于函数的通路、GO 项和化合物分析算法基于二项式分布。

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