miRNAs靶基因预测在线工具—科研工具箱

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进哥哥编写部署的基于multimiR包的miRNAs靶基因批量预测在线shiny小程序miRTarget:

shinyapp.io:https://jingege.shinyapps.io/miRTarget/

图片[1]-miRNAs靶基因预测在线工具—科研工具箱-叨客学习资料网
小程序使用流程
  1. 首先选择你感兴趣的物种,目前只支持三种物种:人(hsa),大鼠(rno)和小鼠(mmu);
  2. 本程序提供了三种检索模式,即(a) 输入miRNAs名称或者目录号预测靶基因;(b)输入靶基因名称预测与其结合的miRNAs;(c)已知一系列miRNAs和一系列候选靶基因,预测miRNAs-mRNAs调控网络;
  3. 输入miRNAs和/或靶基因;
  4. 最后选择检索i模式:实验验证(3个数据库:”mirecords” “mirtarbase” “tarbase”);预测(8个数据库:”diana_microt” “elmmo” “microcosm” “miranda” “mirdb” “pictar” “pita” “targetscan”)。
  5. 点击Search,耐心等待结果出现。
  6. 下载结果,自行根据需求分析,也可使用Venn图在线工具进行交集分析:Venn图在线绘制
  7. 如有问题请留言。
图片[2]-miRNAs靶基因预测在线工具—科研工具箱-叨客学习资料网
结果界面
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