利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱

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荧光图片的拆分和merge应该是科研图片处理中非常基础的一个操作了,Photoshop和Image J等软件都可以完成。这里演示下Image J如何快速拆分和合并。

图片[1]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网

01
荧光图片通道拆分

1、随便打开一张Merge之后的RGB荧光图片;

图片[2]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
2、Image-Color-Channels Tools,选择通道工具;
图片[3]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
3、在弹出来的“Channels”窗口选择第二个,“Color”,在随后的提示信息选择“OK”,将Merge后的RGB图片转换成多通道组合图;
图片[4]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
图片[5]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
原来Merge的RGB图片具有多通道属性(下图最下方的红色框):
图片[6]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
4、Image-Color-Split Channels,拆分通道,即可获得含有伪彩的红、绿、蓝三通道图片;
图片[7]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
图片[8]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网

为什么不直接拆分通道呢?

1、打开图片之后,直接拆分通道,将获得三张没有添加伪彩的通道灰度图片;
图片[9]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
图片[10]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网

2、通过LUT依次为每个通道添加伪彩,才会获得有颜色的拆分通道图;RGB三个通道,要重复三次,比上面的方法稍微麻烦一点点。
图片[11]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网

02 
荧光图片通道Merge
1、打开三张通道图片,Image-Color-Merge Channels,直接Merge;
图片[12]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
2、选好图片和通道对应关系即可,点击“OK”,会自动将三张通道图片Merge成一张RGB图片;
图片[13]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
图片[14]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网
补充:

如果在Merge之后要导出直接能用的tiff格式的图片该怎么操作呢?

Image-Color-Merge Channels的时候,要取消勾选Creatie composite框。否则将带有composition属性,存出来的图片默认会展示最上层的红通道,也就是你存的tiff格式图片是红色的

这跟一些作者须知里面要求合并图层的意思有点类似。而保存成tiff个之外的其他格式的位图则不需要担心这个问题,因为这些位图格式不能保存图层,默认就把图层就合并了。

而在Photoshop里面存储为tiff格式的图片,就算你不合并图层,但也是默认是不展示图层的。

图片[15]-利用Image J拆分和Merge荧光图片—科研工具箱-叨客学习资料网

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