ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱

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常做细胞实验的你可能会做细胞计数吧。所以我们今天来谈谈如何让ImageJ 在细胞计数上发挥功能。而且还是两种方法呢。

方法一:阈值分割法

 

Step1: ImageJ打开一张需要计数的图片。

图片[1]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step2: Image–Type– 8-bit(如下图),将图片转为8-bit图。图片变成黑白图,目标为白色,背景为黑色。

图片[2]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step3: Edit–Invert(如下图),反转图片,目标为黑色,背景为白色。

图片[3]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step4: Image–Adjust–Threshold(如下图),通过阈值窗口中的滑块调节合适的阈值。将目标包含在阈值内。调节合适后,点击阈值窗口中的应用,调节好的区域就变成黑色区域。

图片[4]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

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图片[6]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step5: Analyze——Analyze——Particles。弹出窗口,Size表示设定以像素为单位的区域大小是我们想要计数的。勾选Display results(显示结果),Clear results,Summarize(综述)即可。也可以在Show下拉菜单选择Outlines,展示区域轮廓。

图片[7]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step6: 点击OK,弹出结果窗口,从中我们可以看到计数8个,也可以看到目标区域的整体面积,以及每个目标区的面积。

图片[8]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

方法二:多点工具法

Step1: ImageJ打开一张需要计数的图片。

图片[9]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step2: 激活多点工具,其位置在点工具菜单里,我们右击点菜单,选择多点工具。

图片[10]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step3: 直接在图中点击目标即可,软件会自动在点旁边出现数字代表数量。

图片[11]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step4: 双击点工具菜单,可以修饰点。但记住勾选 Label points。

图片[12]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

Step5: 若点选错误,可以按住Alt,然后单击点,就会去除点,并且重新计数。

图片[13]-ImageJ 技能之细胞计数—科研工具箱-叨客学习资料网

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